ידידי מפעל המקרא
מפעל המקרא נהנה מתמיכה מתמשכת של מוסדות; קרנות וארגונים שונים בארץ ובחו"ל:
האוניברסיטה העברית בירושלים
האקדמיה הלאומית הישראלית למדעים – הקרן הלאומית למדע
הקרן ע"ש פולה ודוד בן-גוריון מייסודה של משפחת פדרמן
יד אבי היישוב
מר לו פריברג, טורונטו, קנדה
מרטין ולואיס זלמן
משרד החינוך, התרבות והספורט
עזבון ד"ר חיים גורדון
קהילת עמנו-אל, ניו-יורק
קרן אדמונד דה רוטשילד
קרן הזכרון לתרבות יהודית
קרן לוציוס נ' ליטאואר
קרן מזרע, יפן
קרן משפחת שואיאר
קרן פדרמן
קרן פרי לחקר המקרא
קרן צ'רלס רוזנבלום